Flensburger Brauerei Emil Petersen er et privat, familieeid bryggeri i Flensburg i delstaten Schleswig-Holstein. Bryggeriet ble grunnlagt 6. september 1888 av fem borgere fra Flensburg og har siden holdt til ved Munketoft. Produksjonen omfatter blant annet pilsnerøl og andre undergjærede øltyper, med regional tilknytning gjennom bruk av kystbygg fra Schleswig-Holstein og vann fra Flensburgs grunnvannskilde.